El estudio, realizado por el estudiante de pregrado Andrés Cartagenova y la estudiante de posgrado y técnico de laboratorio del CISeAL, Karina Zapata, y liderado por el Dr. Fabián Sáenz, investigador principal del CISeAL, en colaboración con el Instituto Broad, la Universidad de Harvard y el Ministerio de Salud de Ecuador, analiza la expansión de un clon de P. falciparum durante un brote en la costa pacífica de Ecuador, un país en fase de eliminación de malaria desde 2012.

Aunque históricamente los casos de P. falciparum han sido bajos en estas zonas (30–200 casos anuales), se han registrado brotes periódicos, destacando los de 2012–2013 y 2019–2020. El estudio subraya que la diversidad genética de P. falciparum en Sudamérica es baja y que la región costera del Pacífico se caracteriza por linajes clonales persistentes, algunos durante más de una década. Esto representa un desafío para la eliminación de la malaria debido a la recombinación limitada y a la propagación de mutaciones de resistencia a medicamentos.

Se recolectaron 72 muestras entre 2019 y 2021 en Esmeraldas, San Lorenzo y Tobar Donoso, con confirmación de infección mediante PCR y tipificación mediante microsatélites neutros en siete loci, complementada con secuenciación del genoma completo de 54 muestras. Los análisis mostraron que todas las muestras fueron monoclonales, con heterocigosidad más alta en San Lorenzo y baja en Esmeraldas, y que las muestras de Esmeraldas 2019–2020 presentaron un haplotipo dominante distinto del brote previo de 2012–2013.

Los resultados de secuenciación del genoma completo confirmaron la propagación clonal, identificando un clon dominante (clúster 20) relacionado con un aislado previamente detectado en Guapi, Colombia, en 2016, mientras que el clúster del brote 2012–2013 (E3) es genéticamente distinto (IBD = 0.032). Esto sugiere que el brote reciente en Esmeraldas probablemente se originó en Colombia y cruzó la frontera hacia Ecuador, lo que resalta la necesidad de investigación y programas de control transfronterizos.

El estudio concluye que linajes genómicos de baja prevalencia pueden causar brotes significativos incluso en áreas en eliminación, destacando la importancia de vigilancia activa, diagnóstico oportuno y tratamientos más agresivos para prevenir la expansión de nuevas infecciones clonales en contextos de eliminación de malaria.

¿Cómo puede un solo clon de P. falciparum generar un brote en la costa de Ecuador, a pesar de los esfuerzos por eliminar la malaria desde 2012?

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https://link.springer.com/article/10.1186/s12879-026-12516-2